BCAA desteklerinin tüketilmesi çoğu kişi için genellikle güvenlidir ve yan etkisi yoktur.
BCAA’nın yüksek düzeydeki güvenli kullanım miktarları konusundaki çalışmalar azdır, ama çalışmalar günde 15 – 35 gram arası toplam BCAA kullanımının genellikle güvenli olduğunu bildirmektedir (1, 48).
Ancak BCAA destekleri, Lou Gehrig hastalığı olarak da bilinen ALS hastaları için önerilmemektedir (49).
Bunun yanı sıra, akçaağaç şurubu idrar hastalığı adlı nadir görülen bir doğumsal hastalığı olan kişiler BCAA alımlarını sınırlandırmalıdırlar, çünkü vücutları bunları tam olarak parçalayamaz (50).